后秦主姚苌进军到河西攻打西燕主慕容永，慕容永逃走。兰椟又列兵拒守，姚苌攻打他，十二月，活捉兰椟，于是前往杏城。
后秦姚方成攻打前秦雍州刺史徐嵩的堡垒，攻了下来，抓住徐嵩并责备他。徐嵩骂道：“你姚苌罪该万死，苻黄眉想斩你，先帝（苻坚）阻止了。先帝在朝廷内外任用你，荣宠到了极点。你却连犬马都不如，不懂感恩，亲自做下大逆不道的事。你们羌人哪能用人的道理来期望！何不快点杀了我，让我早点去见先帝，在地下找姚苌算账！”姚方成发怒，把徐嵩斩成三段，把他的士兵全部活埋，把他的妻子儿女赏给士兵。后秦主姚苌挖开前秦主苻坚的尸体，鞭打无数次，剥去衣服让尸体，用荆棘垫着，挖个土坑埋了。
凉州发生大饥荒，一斗米值五百钱，出现人吃人的现象，死的人超过一半。
吕光的西平太守康宁自称匈奴王，杀了河湟太守强禧反叛。张掖太守彭晃也反叛，向东联合康宁，向西勾结王穆。吕光想亲自去攻打彭晃，将领们都说：“现在康宁在南边，伺机而动。如果彭晃、王穆还没诛杀，康宁又来进攻，我们进退两难，形势必定非常危险。”吕光说：“确实像你们说的那样。但我现在不去，就是坐等他们来攻。如果三个敌寇联合，东西夹击，那么城外就都不是我们的了，大事就完了。现在彭晃刚反叛，和康宁、王穆交情还不深，趁他们仓促起事，打败他们比较容易。”于是亲自率领三万骑兵，日夜兼程。到达后，攻打了二十天，攻下张掖城，杀了彭晃。
当初，王穆起兵，派使者招请敦煌隐士郭瑀，郭瑀运送三万石粮食资助他。王穆任命郭瑀为太府左长史、军师将军，郭嘏为敦煌太守。不久王穆听信谗言，领兵攻打郭嘏，郭瑀劝谏不听，出城大哭，举手向城池告别说：“我再也见不到你了！”回去后用被子蒙住脸，不跟人说话，绝食而死。吕光听说后，说：“两个敌寇互相攻打，这是被擒的时机，不能因为害怕多次作战的劳苦而失去一劳永逸的机会。”于是率领两万步兵骑兵攻打酒泉，攻了下来，进军驻扎在凉兴；王穆领兵东返，还没到目的地，部众溃散，王穆单骑逃跑，髐马令郭文斩下他的首级送给吕光。
太元十三年戊子，即公元388年：
春天正月，康乐献武公谢玄去世。
二月，前秦主苻登在朝那驻军，后秦主姚苌在武都驻军。
翟辽派司马眭琼到后燕谢罪；慕容垂因为他多次反复，杀了眭琼，与他断绝关系。翟辽于是自称魏天王，改年号为建光，设置百官。
后燕青州刺史陈留王慕容绍被平原太守辟闾浑逼迫，退到黄巾固驻扎。慕容垂改任慕容绍为徐州刺史。辟闾浑是辟闾蔚的儿子，趁苻氏大乱，占据齐地前来投降东晋。
三月乙亥日，后燕主慕容垂让太子慕容宝录尚书事，把政事交给她，自己只总揽大纲。
后燕赵王慕容麟攻打许谦，打败了他，许谦逃奔西燕。于是废除代郡，把那里的百姓全部迁到龙城。
吕光平定凉州，杜进功劳最大。吕光任命他为武威太守，对他的宠爱和任用超过其他官员。吕光的外甥石聪从关中过来，吕光问他：“中州人说我治理政务怎么样？”石聪说：“只听说有杜进，没听说有舅舅您。”吕光因此忌恨杜进，杀了他。
吕光和僚属宴饮，谈到政事，参军京兆人段业说：“明公用法太严厉了。”吕光说：“吴起不讲恩德而楚国强大，商鞅施行严刑而秦国兴盛。”段业说：“吴起被杀害，商鞅家族被灭，都是因为残酷到了极点。明公正开创大业，应该效法尧、舜，还怕不成功，却羡慕吴起、商鞅的治理方式，这难道是凉州百姓所期望的吗？”吕光神色变得严肃，向他道歉。
夏季西月戊午日，东晋任命朱序为都督司、雍、梁、秦西州诸军事、雍州刺史，戍守洛阳。任命谯王司马恬代替他为都督兖、冀、幽、并诸军事、青、兖二州刺史。
苑川王乞伏国仁在平襄打败鲜卑越质叱黎，俘获他的儿子越质诘归。
丁亥日，后燕主慕容垂立夫人段氏为皇后，让太子慕容宝兼任大单于。段氏是右光禄大夫段仪的女儿；她的妹妹嫁给了范阳王慕容德。段仪是慕容宝的舅舅。追谥前妃段氏为成昭皇后。
五月，前秦太弟苻懿去世，谥号为献哀。
翟辽迁到滑台驻扎。
六月，苑川王乞伏国仁去世，谥号宣烈，庙号烈祖。他的儿子乞伏公府还年幼，部下推举乞伏国仁的弟弟乞伏乾归为大都督、大将军、大单于、河南王，大赦天下，改年号为太初。
魏王拓跋珪在弱落水以南打败库莫奚。秋季七月，库莫奚又袭击魏营，拓跋珪再次击败他们。库莫奚原本属于宇文部，与契丹是同类但不同种，他们的祖先都被燕王慕容皝打败，迁徙到松漠之间居住。
前秦和后秦从春季起就相持不下，多次交战，互有胜负，到这时各自罢兵返回。关西的豪杰因为后秦长期没有取胜，大多离开后秦而依附前秦。
河南王乞伏乾归立他的妻子边氏为王后；设置百官，仿照汉朝制度，任命南川侯出连乞都为丞相，梁州刺史悌眷为御史大夫，金城人边芮为左长史，东秦州刺史秘宜为右长史，武始人翟勍为左司马，略阳人王松寿为主簿，堂弟乞伏轲弹为梁州牧，弟弟乞伏益州为秦州牧，屈眷为河州牧。
八月，前秦主苻登立儿子苻崇为皇太子，苻弁为南安王，苻尚为北海王。
后燕护军将军平幼会同章武王慕容宙讨伐吴深，打败了他，吴深逃走据守绎幕。
魏王拓跋珪暗中有图谋后燕的志向，派遣九原公拓跋仪奉命出使到中山，后燕主慕容垂责问他说：“魏王为什么不亲自来？”拓跋仪说：“先王与燕一同侍奉晋室，世代为兄弟，我现在奉命出使，在道理上没有错。”慕容垂说：“我如今威势遍及天下，怎能用过去来相比！”拓跋仪说：“燕如果不修养德政礼仪，想凭借武力威势自强，这是将帅的事，不是使臣所能知道的。”拓跋仪返回后，对拓跋珪说：“燕主衰老，太子昏庸懦弱，范阳王自恃有才气，不会甘心做少主的臣子。燕主死后，内部必定发生祸乱，到那时才可以图谋，现在还不行。”拓跋珪认为他说得对。拓跋仪是拓跋珪同母弟弟拓跋翰的儿子。
九月，河南王乞伏乾归迁都到金城。
张申攻打广平，王祖攻打乐陵；壬午日，后燕高阳王慕容隆领兵讨伐他们。
冬季十月，后秦主姚苌返回安定。前秦主苻登到新平谋取军粮，率领一万多部众包围姚苌的营地，西周大哭；姚苌命令营中士兵哭着回应他们，苻登才退军。
十二月庚子日，尚书令南康襄公谢石去世。
后燕太原王慕容楷、赵王慕容麟领兵在合口与高阳王慕容隆会合，攻打张申；王祖率领各堡垒的人共同救援，夜里袭击后燕军，后燕军迎击打退了他们。慕容隆想追击，慕容楷、慕容麟说：“王祖是老贼，或许会假装逃跑而设下埋伏，不如等天亮再说。”慕容隆说：“这些是没有根据地的盗贼，乌合之众前来，希望侥幸一战取胜，不是向来有约束，能统一进退的。现在战败离去，部众不能为他所用；乘势追击，不过几里路，就能全部擒获。张申所依仗的，只有王祖，王祖被打败，张申就会投降了。”于是留下慕容楷、慕容麟防守张申的堡垒，慕容隆与平幼分路追击，到天亮时，俘获大量人口物资而返回，把所获的首级悬挂起来向张申展示。甲寅日，张申出城投降，王祖也认罪投降。
前秦任命颍川王苻同成为太尉。
太元十西年己丑，即公元389年：