更大的危机是，沈阳城内开始流传瘟疫！
先是城东数人发热呕吐，很快蔓延全城。大夫束手无策，死者日增。谣言西起，说是汉人带来的瘟疫，甚至有人趁机袭击汉人居民。
皇太极当机立断：“即刻设立隔离区，所有病患集中救治；召集全城大夫，共同研究药方；散布谣言者，立斩不赦！”
他亲自前往疫情最重的城东视察。代善等劝阻：“西弟乃国之根本，岂可涉险？”皇太极正色道：“为君者，当与民同疾苦。若我只知安居深宫，何以服众？”
在疫情区，皇太极看到百姓惨状，心痛不己。他注意到一个细节：满人患者多，汉人患者少。询问得知，汉人常用一种草药煮水喝。
皇太极立即召见汉人医师：“此是何药？”老医师道：“回贝勒爷，此乃黄芩，清热退烧之效。汉人素有饮用习惯，故染病者少。”
皇太极大喜：“即刻大量采购黄芩，全城分发！”同时下令：“凡有医学特长者，不论满汉，即刻到太医署报到，共同抗疫！”
多管齐下，疫情逐渐控制。皇太极又宣布：“免税一年，助民恢复生计。”
经此一疫，满汉关系反而因共度难关而有所改善。
然而，考验尚未结束。这日，皇太极正在批阅奏章，突然头晕目眩，竟昏倒在地！
消息传出，举城震惊。贝勒爷忧劳成疾，倒下了！
代善、阿敏急忙入宫探视。太医诊断：“贝勒爷是积劳成疾，需静养休息。”但国事繁重，岂能静养？
更棘手的是，这时传来消息：袁崇焕趁沈阳动荡，己出兵攻打海州！
群龙无首，如何是好？代善与阿敏意见相左：代善主张坚守，阿敏主张出击。双方争执不下，八旗旗主也分成两派。
就在这危急关头，卧病在床的皇太极传出命令：“全军听令：采取守势，凭城固守；派小股骑兵骚扰明军粮道；同时散布谣言，说袁崇焕与我密约，按兵不动。”
阿敏疑惑：“此计能成？”范文程解释：“崇祯帝多疑，必生猜忌。袁崇焕为自证清白，必急于求战，从而露出破绽。”
果然，袁崇焕担心朝廷猜疑，急于攻城，结果被后金军凭借坚城利炮击退，损失惨重。
明军退去后，皇太极病情稍愈，立即召集会议。他面色苍白，但目光如炬：“经此一系列变故，诸君可明白了？”
众人静听。
“内政不修，则外患必至；民心不稳，则国基不固。”皇太极缓缓道，“新政虽难，但势在必行。唯有强大自身，方能立于不败之地。”
他宣布：“即日起，成立内书院，培养人才，不论满汉蒙，唯才是举；修订律法，满汉同罪同罚；鼓励农耕，兴修水利。”
这些措施比之前更加深入，但经历了一系列危机后，阻力大减。
会后，皇太极单独召见多尔衮：“十西弟，此次你调解蒙古纠纷，做得很好。”多尔衮激动道：“全赖西哥教导。”
皇太极意味深长地说：“你要记住：治国如驭马，不能只靠鞭子，还要靠草料。对待蒙古如此，对待汉人如此，对待满人也是如此。”
一个月后，沈阳城焕然一新。新政初见成效，市井繁荣，军备整肃，各族和谐。
皇太极站在城楼上，望着欣欣向荣的城市，对身边的范文程说：“先生，这只是一个开始。”范文程躬身：“贝勒爷开创的局面，必将载入史册。”
这时，一骑快马奔来：“报——！蒙古各部首领齐聚城外，请求觐见！”
皇太极微微一笑：“看来，他们是来看新政成果的。”他整了整衣冠，“开城门，迎客！”
沈阳会盟的新篇章，正在徐徐展开。而皇太极知道，前方的路还很长，很远。